貝瑞基因
6月30日下午,貝瑞基因(000710.SZ)向外界公布了三代測序儀科研的最新進(jìn)展:由公司參與完成的三代SMA(脊髓性肌萎縮癥)臨床回顧性研究成果,近期發(fā)表于分子診斷領(lǐng)域權(quán)威國際學(xué)術(shù)期刊 Journal of Molecular Diagnostics(即時(shí)IF=5.568)。此次研究證明,公司三代SMA相比qPCR、MLPA等傳統(tǒng)檢測方法,覆蓋更全面,檢測更精準(zhǔn)。
就三代SMA的市場前景等,貝瑞基因董事長高揚(yáng)接受鈦媒體采訪時(shí)表示:“可以看到SMA、CAH、地貧、FXS的單病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)并不高,但是在生育過程中,夫妻雙方單個(gè)人攜帶的風(fēng)險(xiǎn)其實(shí)是很高的,所以這也是為什么攜帶者篩查的市場需求較大(的原因)?!?/p>
【資料圖】
擴(kuò)展性攜帶者篩查未來存在較大的市場空間。貝瑞基因市場總監(jiān)趙智賢分析認(rèn)為,2021年我國結(jié)婚登記人數(shù)763.6萬對(duì),擴(kuò)展性攜帶者篩查平均市場單價(jià)按2000元/例計(jì)算,理論篩查比例按照產(chǎn)業(yè)篩查率達(dá)到65%推算,2021年理論擴(kuò)展性攜帶者篩查市場容量預(yù)計(jì)高達(dá)198.5億元。
SMA口服藥堪稱“天價(jià)”,攜帶者篩查尤為必要
據(jù)了解,此次三代SMA研究成果由中國福利會(huì)國際和平婦幼保健院與貝瑞基因聯(lián)合發(fā)表,中國福利會(huì)國際和平婦幼保健院王彥林教授和貝瑞基因毛愛平博士為這項(xiàng)研究的通訊作者。
公開資料顯示,SMA即脊髓性肌萎縮癥(Spinal Muscular Atrophy),是一類由脊髓前角運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元變性導(dǎo)致肌無力和肌萎縮的遺傳性肌肉疾病。SMA為嬰幼兒中第二常見的致死性常染色體隱性遺傳病,人群攜帶率為1/72-1/47,發(fā)病率為1/10000-1/6000。
雖攜帶率不算高,但一旦患上此病,只能修正治療不能根治,且昂貴的治療費(fèi)用讓諸多家庭望而卻步。據(jù)山東省藥械集中采購平臺(tái)近日公告,SMA口服藥利司撲蘭主動(dòng)申請(qǐng)降價(jià),調(diào)整后價(jià)格為每瓶1.45萬元。按年齡體重計(jì)算,價(jià)格調(diào)整后最大使用劑量患者年治療費(fèi)用將低于45萬元。
顯然,SMA攜帶者篩查才是降低該病種發(fā)病率的良方。據(jù)貝瑞基因三代事業(yè)部總監(jiān)任志林介紹, SMA攜帶者分三種情況:91-94%的攜帶者只有一個(gè)正常功能的SMN1拷貝(1+0),2-5%的攜帶者含有兩個(gè)SMN1拷貝,但其中一個(gè)包含致病點(diǎn)突變(1+1D),另外4%為沉默型攜帶者,即有兩個(gè)SMN1拷貝,但都位于同一條染色體上(2+0)。目前qPCR、MLPA等傳統(tǒng)基因檢測方法無法檢測1+1D和2+0攜帶者,殘余風(fēng)險(xiǎn)最高可達(dá)1/415(1/1245-1/415)。
而三代測序具有超長讀長、無GC偏好、對(duì)高度重復(fù)等復(fù)雜區(qū)域也能夠準(zhǔn)確測序等技術(shù)優(yōu)勢(shì),且技術(shù)成本持續(xù)下降,2025年將實(shí)現(xiàn)與二代測序成本持平。在此基礎(chǔ)上,貝瑞基因開發(fā)出三代SMA基因全面檢測技術(shù),全球首次實(shí)現(xiàn)SMN1及SMN2基因近30kb全長序列的高效率三代HIFI測序。CASMA還能同時(shí)檢測SMN1及SMN2基因拷貝數(shù)、全基因范圍內(nèi)致病性SNVs及Indels,并主動(dòng)提示沉默型“2+0”的攜帶風(fēng)險(xiǎn)。
此次三代SMA回顧性臨床研究顯示,CASMA一次性精準(zhǔn)檢測所有337例樣本的SMN1及SMN2基因拷貝數(shù),對(duì)SMN1拷貝數(shù)缺失的檢測靈敏度高達(dá)100%。CASMA還成功檢測出4例會(huì)被qPCR、MLPA等傳統(tǒng)方法漏檢的SMN1基因點(diǎn)突變攜帶者(1+1D)。通過專利分析方法,CASMA直接預(yù)測出全部7例(來自4個(gè)家系)已知“2+0”型攜帶者。數(shù)據(jù)顯示,CASMA能大大改善SMA患者基因診斷及預(yù)后判斷,提高SMA新生兒基因篩查效率,將攜帶者檢出率從91-94%提高到98%以上,將殘余風(fēng)險(xiǎn)降低4-5倍。
下一站場景,一鍵解決單基因全病種檢測
事實(shí)上,三代SMA只是貝瑞基因三代測序臨床轉(zhuǎn)化體系中的一塊拼圖。不久前,由貝瑞基因提供技術(shù)支持的三代CAH(先天性腎上腺皮質(zhì)增生癥)臨床回顧性研究成果,發(fā)表于檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域權(quán)威國際學(xué)術(shù)期刊Clinical Chemistry(即時(shí)IF=11.784)。更早一些,2021年上半年,公司發(fā)起了地中海貧血基因圖譜(TiGA)計(jì)劃。2021年7月,由貝瑞基因提供技術(shù)支持的三代地貧多中心臨床前瞻性研究成果在The Journal of Molecular Diagnostics 上發(fā)表。
此外,貝瑞基因還有21臺(tái) PacBio Sequel II/IIe 三代測序儀儲(chǔ)備,目前公司已將三代測序技術(shù)觸達(dá)多種罕見病,包括三代地貧、三代CAH、三代SMA等產(chǎn)品相繼落地。其中,三代地貧檢測試劑盒近期取得醫(yī)療器械注冊(cè)倫理批件,進(jìn)入臨床試驗(yàn)階段。三代CAH和三代SMA技術(shù)則在2022年取得發(fā)明專利證書。
貝瑞基因三代事業(yè)部總監(jiān)任志林接受鈦媒體采訪時(shí)表示:“把三代測序技術(shù)用在生殖健康領(lǐng)域、以及出生缺陷防控領(lǐng)域,在我們這樣一個(gè)人口基數(shù)非常龐大的國家是很有價(jià)值的,有臨床的實(shí)用性和前瞻性,而且我們也能想到這些遺傳病不只是中國人的問題,實(shí)際上是全球的問題?!?/p>
對(duì)于三代測序的下一站應(yīng)用場景,“一鍵解決”單基因全病種檢測是貝瑞基因的目標(biāo)。貝瑞基因介紹,因?yàn)楣镜母鞣N產(chǎn)品是高度兼容,所以更容易實(shí)現(xiàn)一次性解決多種疾病,而從一到多,準(zhǔn)確性不會(huì)受到影響。(首發(fā)鈦媒體,作者|張海霞,編輯|崔文官)
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